覆盖酿酒酵母（S. cerevisiae）、毕赤酵母（P. pastoris）及丝状真菌等真核微生物的遗传操作服务，提供基因敲除、过表达、分泌表达系统搭建及代谢通路重构，适用于工业酶制剂、重组蛋白与活性代谢产物生产。
酿酒酵母的 HDR 效率支持 Cas9+供体条带的一次性多靶点操作；Cereghino & Cregg 的综述系统总结了 Pichia 甲醇途径与培养放大。丝状真菌因细胞壁与 NHEJ 占主导，常需 NHEJ 关键因子缺失或胞壁酶解原生质体转化以提升编辑效率。代谢物与工业酶产率优化通常结合启动子、拷贝数与分泌信号肽的迭代（文献与工程案例众多）。
真核微生物兼具较高的同源重组效率和翻译后修饰能力，是工业生物技术的重要底盘生物。
酿酒酵母天然具有高效的同源重组修复（HDR），配合CRISPR/Cas9可实现接近100%效率的精确基因编辑，无需选择标记即可完成无痕编辑。
毕赤酵母（Komagataella phaffii）以AOX1甲醇诱导启动子为核心，可实现重组蛋白克/升级别的高效分泌表达，具备真核糖基化修饰能力，是工业蛋白生产的重要宿主。
米曲霉（A. oryzae）、黑曲霉（A. niger）、木霉（T. reesei）等丝状真菌是工业纤维素酶、蛋白酶和有机酸的主要生产菌株，通过CRISPR或原生质体转化实现精准基因组改造。
酵母基因组多位点整合可显著提高重组蛋白产量并保持遗传稳定性，常用策略包括δ序列整合（Ty1转座子）、rDNA位点整合和同源重组定点整合。
| 宿主 | 糖基化类型 | 分泌能力 | 遗传操作 | 主要应用 |
|---|---|---|---|---|
| S. cerevisiae | 高甘露糖（核心） | 中等 | 成熟，HDR效率高 | 乙醇、蛋白、代谢产物 |
| P. pastoris | 高甘露糖（可人源化） | 高（g/L） | 较成熟，CRISPR可用 | 工业蛋白、酶制剂 |
| A. niger / oryzae | 复杂型（部分） | 高 | 原生质体转化，较难 | 有机酸、纤维素酶、蛋白酶 |
| T. reesei | — | 极高（纤维素酶） | 中等 | 纤维素降解、生物燃料 |
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